ต้องปิดมิดชิด เนื่องจากต้องการความสะอาด ป้องกันฝุ่น และรักษาอุณหภูมิจากเครื่องปรับอากาศ

   ประตูหรือหน้าต่างเป็นกระจก นอกจากผลพลอยได้ที่ทำให้ห้องดูดีแล้ว ประโยชน์ที่สำคัญคือ หากบุคคลภายนอกมาดูงานจำนวนมาก สามารถให้ชมภายนอกได้ และการนำหัวเชื้อออกจากห้องก็สะดวก ข้อเสียมีบ้าง เช่น หากเปิดไฟตอนกลางคืนและประตูมีช่อง แมลงก็จะเข้าในห้องได้ (แต่ปกติกลางคืนจะไม่เปิดไฟ)

   เพดานห้องไม่จำเป็นต้องสูงมาก เนื่องจากต้องการประหยัดไฟเครื่องปรับอากาศ ยกเว้นตู้หรือชั้นวางแพลงก์ตอนสูง

      ห้องปฏิบัติการขยายพันธุ์แพลงก์ตอนพืชจำเป็นต้องมีเครื่องปรับอากาศ เนื่องจากต้องการควบคุมอุณหภูมิให้คงที่ สำหรับศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงชายฝั่งจันทบุรีเปิดเครื่องปรับอากาศเวลา 08.30 น. ปิด 16.30-20.00 น. อุณหภูมิ 25 องศาเซลเซียส

      เครื่องปรับอากาศต้องเลือกใช้แบบที่มีเซนเซอร์คุมอุณหภูมิ (แอร์ที่ไม่มีเซนเซอร์ อุณหภูมิในรอบวันอาจมีช่วงกว้างมากระหว่าง 20-29 องศา ซึ่งส่งผลต่อความแข็งแรงของแพลงก์ตอน) และควรใช้แอร์เบอร์ 5 เพราะประหยัดค่าไฟฟ้า นอกจากนี้ หากตั้งเวลาปิดได้ก็จะสะดวกมาก

      มีพัดลมระบายอากาศติดไว้ เพื่อระบายอากาศ และความชื้นในห้อง

   เครื่องเป่าลม ต้องเปิด 24 ชั่วโมง หากขยายพันธุ์แบบต่อเนื่อง

   ไส้กรองอากาศ มีไว้ก็ดี ถึงใช้เครื่องเป่าอากาศแบบไม่ใช้น้ำมันเครื่อง เช่น แบบ Ring Blower แต่ระยะยาวก็ยังมีเขม่าดำ ๆ หลุดเข้าระบบท่อลมได้บ้าง การติดไส้กรองอากาศก่อนลมจะเข้าห้องก็ช่วยได้บ้าง สำหรับห้องปฏิบัติการขยายพันธุ์แพลงก์ตอนศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงชายฝั่งจันทบุรี ใช้ไส้กรองทำเองแบบง่าย ๆ (ตามภาพ)

   ท่อลมติดชั้นวาง ส่วนมากใช้ท่อ 4-6 หุน ติด 2 แบบ คือ แบบติดขอบชั้นกับแบบติดเพดานชั้น

   หลอดฟูออเรสเซนต์ แบบที่ใช้ตามบ้านก็เพียงพอ ห้องแพลงก์ตอนของศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงชายฝั่งจันทบุรี ชั้นวาง 1 ชั้น พื้นที่วางแพลงก์ตอนขนาดกว้าง 80 เซนติเมตร ยาว 3.30 เมตร ติด 2 ชุด ๆ ละ 6 หลอด (ใช้จริงชุดละ 4 หลอด สำรองหรือเผื่อเร่งแสง 2 หลอด)

   ไม่ควรติดบัลลาสต์ใกล้หลอดไฟ เนื่องจากแพลงก์ตอนต้องวางใกล้หลอดไฟ การติดหลอดฟูออเรสเซนต์แบบบัลลาสต์ใกล้หลอดเหมือนที่ใช้ในบ้าน บัลลาสตก็จะส่งความร้อนให้แพลงก์ตอน ทำให้แพลงก์ตอนอ่อนแอ อย่างน้อยก็ติดบัลลาสต์ไว้ข้างตู้ก็ได้

   ติดบัลลาสต์นอกห้อง ทางเลือกที่ดีกว่า แม้จะเพิ่มค่าใช้จ่ายการติดตั้งบ้าง แต่ทำให้ภายในห้องไม่มีความร้อนจากบัลลาสต์ ช่วยลดค่าไฟของเครื่องปรับอากาศ

   ชั้นยาววางติดผนัง เข้าทำงานได้ด้านเดียว ลักษณะเป็นตู้ยาว สามารถติดหลอดไฟด้านข้างได้ สามารถจััดวางติดผนังห้องเป็นรูปตัวยู

   ชั้นยาววางห่างผนัง ข้อดีคือเข้าทำงานได้ทั้งสองด้าน ห้องแพลงก์ตอนของศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงชายฝั่งจันทบุรีเลือกใช้แบบนี้

   ห้องแพลงก์ตอนบางแห่งใช้ ชั้นยาววางห่างผนังร่วมกับชั้นยาววางติดผนัง ข้อดีคือใช้ประโยชน์พื้นที่ห้องได้เต็มที่

   ชั้นสี่เหลี่ยมวางห่างผนัง สามารถเข้าทำงานได้ทั้งสี่ด้าน

มีตู้ปลอดเชื้อ สำหรับเขี่ยเชื้อลงวุ้น ต่อเองได้ราคาไม่แพง

การเขี่ยเชื้อจากวุ้นลงขวดหรือต่อหัวเชื้อแพลงก์ตอนในงานประจำวัน หากห้องสะอาดปิดมิดชิด ใช้โต๊ะปูแผ่นฟอร์ไมก้า ฉีดแอลกอฮอล์อีกนิด ก็ใช้้

ต้องมีห้อง โรงเรือน หรือพื้นที่ว่างสำหรับเตรียมน้ำ (นึ่งแรงดัน ต้มน้ำ) และที่วางอุปกรณ์ เครื่องแก้ว

ควรมีที่ล้างทำความสะอาดอุปกรณ์ ไม่ควรล้างหรือเตรียมในห้องแพลงก์ตอน

ห้องแพลงก์ตอนของเรามีเจ้าหน้าที่ปฏิบัติงาน 1 คน

ผลิตหัวเชื้อแพลงก์ตอนพืชเพื่อนำไปขยายภายนอก ซึ่งมีหัวเชื้อออกทุกวัน แยกเป็นแพลงก์ตอนพืชสีเขียววันละ 35 ลิตร แพลงก์ตอนพืชสีน้ำตาลวันละ 35 ลิตร (หากผลิตเต็มชั้นวางจะมีหัวเชื้อออกรวมทั้งสองชนิดวันละ 140 ลิตร)